Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q71RC1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q71RC1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q71RC1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q71RC1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q71RC1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q71RC1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q71RC1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q71RC1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms