Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP43Q70EL4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP43Q70EL4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms