Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BBS12Q6ZW61 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BBS12Q6ZW61 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms