Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVL6

KIAA1549L, UPF0606 protein KIAA1549L, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549LQ6ZVL6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KIAA1549LQ6ZVL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KIAA1549LQ6ZVL6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms