Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPGS1Q6ZTW0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPGS1Q6ZTW0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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