Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBR3Q6ZT12 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms