Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CAPN12Q6ZSI9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN12Q6ZSI9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN12Q6ZSI9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms