Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI2Q6ZQN5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FOXI2Q6ZQN5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms