Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NFXL1Q6ZNB6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NFXL1Q6ZNB6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms