Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM72Q6ZMU5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms