Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN8

CCNI2, Cyclin-I2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNI2Q6ZMN8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCNI2Q6ZMN8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCNI2Q6ZMN8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms