Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC36A4Q6YBV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC36A4Q6YBV0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms