Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VITQ6UXI7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VITQ6UXI7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.3 ms