Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TTC41PQ6P2S7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTC41PQ6P2S7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms