Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC42EP5Q6NZY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC42EP5Q6NZY7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms