Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3HQ6NTF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms