Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TXNDC8Q6A555 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TXNDC8Q6A555 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms