Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CST9Q5W186 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CST9Q5W186 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms