Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ECM29Q5VYK3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM29Q5VYK3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM29Q5VYK3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms