Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PRAMEF6Q5VXH4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRAMEF6Q5VXH4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms