Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SAMD13Q5VXD3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms