Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SUSD4Q5VX71 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SUSD4Q5VX71 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms