Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM164Q5U3C3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM164Q5U3C3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms