Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RSPH4AQ5TD94 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RSPH4AQ5TD94 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms