Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7N2

L1TD1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1TD1Q5T7N2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
L1TD1Q5T7N2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
L1TD1Q5T7N2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms