Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BEND3Q5T5X7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BEND3Q5T5X7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BEND3Q5T5X7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms