Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NOM1Q5C9Z4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOM1Q5C9Z4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms