Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC178Q5BJE1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC178Q5BJE1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms