Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSP90AA4PQ58FG1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSP90AA4PQ58FG1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms