Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDK2Q58EX2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDK2Q58EX2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms