Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKDCCQ504Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDCCQ504Y2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms