Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTXN3Q4LDR2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CTXN3Q4LDR2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms