Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LINC00303Q3SY05 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LINC00303Q3SY05 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms