Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TWISTNBQ3B726 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TWISTNBQ3B726 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms