Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDO1Q16878 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms