Protein–RNA interactions for Protein: Q16864

ATP6V1F, V-type proton ATPase subunit F, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1FQ16864 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ATP6V1FQ16864 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP6V1FQ16864 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms