Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CRY1Q16526 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRY1Q16526 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CRY1Q16526 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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CRY1Q16526 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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CRY1Q16526 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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CRY1Q16526 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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CRY1Q16526 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRY1Q16526 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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