Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNXAQ16473 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNXAQ16473 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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