Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC6Q16204 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC6Q16204 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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