Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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ZNF56Q15929 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF56Q15929 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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