Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USF2Q15853 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
USF2Q15853 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
USF2Q15853 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USF2Q15853 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USF2Q15853 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USF2Q15853 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms