Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
NPTX1Q15818 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NPTX1Q15818 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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