Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALX1Q15699 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALX1Q15699 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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