Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIP13Q15645 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIP13Q15645 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms