Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDSNQ15517 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDSNQ15517 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDSNQ15517 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDSNQ15517 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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