Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SF3B3Q15393 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SF3B3Q15393 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SF3B3Q15393 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms