Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRRQ15256 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPRRQ15256 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms