Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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CHD4Q14839 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
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CHD4Q14839 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHD4Q14839 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
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CHD4Q14839 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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CHD4Q14839 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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CHD4Q14839 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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CHD4Q14839 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
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CHD4Q14839 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
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CHD4Q14839 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHD4Q14839 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
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