Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRIM25Q14258 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRIM25Q14258 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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