Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARF1Q14162 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARF1Q14162 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms